في خطوة مفاجئة قدم البروفيسور مالك حسين إستقالته من حزب المستقلين ، لكن المؤتمرين رفضوا الإستقالة على أن يناقش في 7 أبريل 2018م إلا أن مالك حسين أصر على الإستقالة ،
وبحسب صحيفة المجهر ذكر أنه سيظل عضواً فاعلاً في الحزب نسبة للظروف الراهنة التي يمر بها السودان .
